Pada 1 Januari 2007, 12:55 waktu tempatan(05:55 UTC), kapalterbang berkenaan telah berlepas dari Surabaya membawa 96 penumpang (85 dewasa, 7 kanak-kanak dan 4 bayi)[7] dan enam anak kapal.[1] Laluan penerbangan dua jam, masa pendaratan di Manado telah dijadualkan pada 16:00 waktu tempatan,[note] adalah normal sehingga kapalterbang itu hilang dari radar pengawal trafik udara di Makassar, Sulawesi Selatan dengan hubungan terakhir pada 14:53 waktu tempatan (06:53 UTC). Kedudukan suar terakhir diketahui dikesan oleh satelit Singapura pada 1.30° S 124.45° E.[7] Ketinggian kapalterbang menunjukkan pada paras 35,000 kaki (10,668 meter) pada skrin on the radar.[8]

Cuaca di kawasan tersebut adalah ribut;[9] Institut Meteorologi dan Geofizik Indonesia telah menyatakan bahawa ketebalan awan setinggi 30,000 kaki (9,144 meter) dan laju angin pada 30 knot (55.56 km/j) di dalam kawasan berkenaan.[10] Kapalterbang berkenaan telah menghantar dua isyarat kecemasan sebelum hubungan terputus.[11] Jenis isyarat menunjukkan satu "peluang besar ia telah mengalami kemalangan atau satu nahas" merujuk kepada pegawai tentera landasan kapalterbang.[12]

Senarai penumpang sebahagian besarnya terdiri daripada warganegara Indonesia; Orang luar hanyalah satu keluarga Amerika Syarikat terdiri daripada tiga orang.[13][14]